JR九州は4月20日、熊本地震の影響で全線の運転を見合わせている九州新幹線について、新水俣（熊本県水俣市）～鹿児島中央（鹿児島市）間のみ本数を減らして再開する。残る博多～新水俣間は、新玉名～新八代間を中心に施設の被害が激しく、全線再開のめどはたっていない。
三重県四日市市はこのほど、四日市あすなろう鉄道に導入する新しい車両のデザイン案の投票結果を発表した。「グリーンカラー」をベースにしたデザイン案が1位を獲得した。
JR貨物は4月18日、熊本地震の救援物資輸送に対応した臨時貨物列車を、吹田貨物ターミナル（大阪府吹田市）～福岡貨物ターミナル（福岡市東区）間で運行すると発表した。吹田発は4月19日から当分の間運行し、福岡発も4月20日から当分の間運行する。
JR東日本の東京・横浜両支社は4月19日、東海道本線の特急『踊り子』で車掌による車内改札（検札）をやめると発表した。4月25日から開始する。
国土交通省や鉄道各社局などの発表によると、熊本地震の影響で運休中の鉄道路線は、4月19日17時50分時点で535.0km（営業距離ベース）。運休区間は以下の通り。
国土交通省や鉄道各社局の発表によると、熊本地震による鉄道の運休距離は、4月18日の18時30分時点で558.5km（営業距離ベース）。鹿児島本線（熊本以北）などの再開により、全体では600kmを割り込んだ。
熊本地震の影響で運転を見合わせている熊本電気鉄道は4月17日、藤崎宮前（熊本市中央区）～北熊本（北区）～御代志（熊本県合志市）間の運行を18日の初発から再開すると発表した。18日は月曜日だが、日曜・祝日ダイヤでの運行になる。
工学院大学の曽根悟特任教授は、4月16日の同大学公開講座で、「日本には中速鉄道というカテゴリが存在しない。在来線では、京成スカイライナーの一部区間に160km/h運転が存在するだけ。低速か高速しかない、いびつな関係」と伝え、在来線の高速化について語った。
日本の鉄道の可能性や課題について学ぶ公開講座『鉄道イノベーション~もっと身近で便利な鉄道に~ 』が16日、工学院大学の新宿キャンパスで開催された。会場には募集予定の200人を大きく超え、300人近くの聴講者が参集。大盛況となった。
洲原～母野間の須原トンネル（岐阜県美濃市）で発生した脱線事故の影響で、一部区間の運行を見合わせている長良川鉄道は、4月18日から運行区間を美濃太田～美濃市間17.7kmに拡大する。これに伴い代行バスの運行区間も、美濃市～北濃間54.4kmに縮小する。
