首都高速と阪神高速の都市高速については、無料化の対象外となっているが、新たに上限料金を設定した対距離料金制に変わる。NEXCO系よりスタートは遅れる。
首都高速と阪神高速の料金は、
普通車=500円 - 900円
大型車=1000円 - 800円
新しい対距離料金制下では、現行の料金圏が廃止され、首都高速、阪神高速のエリア内であれば、どこまで走っても上限料金ですむ。
現行では料金圏をまたぐと、料金が加算されていた。例えば、普通車や二輪車で新宿(東京圏)からみなとみらい(神奈川圏)まで首都高速を利用すると、東京圏(700円)と神奈川圏(600円)をまたぐので、1300円必要になるが、新料金制の下では900円になる。
ただ、対距離料金制では、休日3割引など曜日や時間を限定した割引は廃止する。
そのため休日の料金圏をまたぐ通行や距離によっては、現行より値上げとなる場合がある。