JR九州は7月11日、大雨の影響で一部区間の運転を見合わせている日田彦山線と久大本線の被害状況を発表した。久大本線の光岡～日田間（大分県日田市）で橋りょうが流失したほか、日田彦山線でも大きな被害が発生している。
JR九州は7月11日、久大本線の一部不通の影響で運休している特急『ゆふ』『ゆふいんの森』のうち、『ゆふいんの森』を迂回（うかい）ルートで7月15日から運行すると発表した。切符は7月13日から発売する。
一般社団法人・日本民営鉄道協会（民鉄協）は7月10日、箱根登山鉄道をテーマにした鉄道体験学習デジタル教材を、7月14日から同協会のウェブサイトで公開すると発表した。
JR東日本東京支社は7月10日、東北本線上野駅（東京都台東区）の公園口を移設すると発表した。
JR北海道は7月10日、函館本線札幌駅（札幌市中央区）で使用している地下水に、「テトラクロロエチレン」という成分が基準値を超過して検出されていたことを明らかにした。
養老鉄道と樽見鉄道の2社は7月10日、「養鉄樽鉄谷汲山ミニ周遊券」を7月22日から発売すると発表した。岐阜県内の観光地として知られる谷汲山華厳寺（揖斐川町）の観光客向けに発売するもので、2社の鉄道路線を利用できる。
国土交通省がまとめた7月10日12時時点の情報によると、6月30日からの大雨と台風3号の影響で運転を休止している鉄道路線は、黒部峡谷鉄道とJR九州の2社3線となった。
JR東日本の千葉支社は7月10日、京葉線の沿線に本拠地を持つスポーツ6チームのラッピング列車を運行すると発表した。8月1日に列車のお披露目イベントが行われる。
JR東日本の水戸支社は7月7日、常磐線などのダイヤ改正を10月14日に実施すると発表した。常磐線の品川直通を強化する一方、水郡線などで列車の減便を行う。
JR東日本千葉支社は8月27日、両国駅（東京都墨田区）～木更津駅（千葉県木更津市）間で「サイクルトレイン」を運行する。
