『eKワゴン』はモノグレード展開ということで、用意されたエンジンも1種類。3気筒SOHCエンジンに、3ATの組み合わせのみとなった。このエンジンは、『トッポBJ』に搭載している「3G83」からリーンバーン機構を外している。一見スペックダウンのように見えるが、乗用車開発本部・商品開発プロジェクトの篠倉崇主任は、「排出ガス軽減と、中速域のドライバビリティー向上のために通常のMPIヘッドにしました」と語る。
『MAX』には、過給器や気筒数の違いで、3気筒DOHC、3気筒DOHCターボ、4気筒DOHCターボ、以上3種類のエンジンが用意される。排気量は660ccで共通、全車に可変バルブタイミング機構が装備される。
日産自動車は、同社の2000年度の環境対応の実績をまとめた「2001年3月期環境報告書」を発行した。