新型『MRワゴン』には、2種類のインテリアカラーが用意されている。ややオレンジ味を帯びた明るいブラウンの「アイボリー」と、座面やヘッドレストに濃色ブラウンを使った「マルーン」だ。インテリアの材質は両者共通。
アイボリーは「やわらかな光に包まれて、親子が朝食を楽しむ時間」を、マルーンは「夜、落ち着いたダウンライトのもとで、子供と絵本を楽しむ時」をイメージしたものだという。カラーコーディネーションを担当した山内朋子氏は、「とくにマルーンについては、軽自動車では珍しい内装色ということで、調色に工夫を重ねました。どちらの色も、女性としてのお洒落感覚を味わえるものにできたと思っています」と語る。実際、2トーンカラーが際立つマルーン内装はかなり個性的で、かつ上質な印象を与える。
内装色はボディカラーによって選択可能なパターンが異なる。両方を選べるのは「ストロベリーパールメタリック」「シルキーシルバーメタリック」「マルーンブラウンパール」の3色。「ブルーイッシュブラックパール」はマルーンのみ、「パールホワイト」「ミルクティベージュメタリック」「レイクブルーメタリック」「ラグーンターコイズメタリック」はベージュのみとなる。