名古屋鉄道（名鉄）は、夏休み恒例のスタンプラリーとして「名鉄沿線夏休み ポケモンスタンプラリー2013トライアングル」を7月13日から9月1日まで実施する。これに合わせて期間限定のフリー切符も発売する。
相模鉄道（相鉄）は、相鉄・JR直通線（2018年度開業予定）の整備事業に関連した深夜の走行試験を6月24・30日に実施する。
JR九州は6月19日、クルーズトレイン「ななつ星in九州」の第3期（2014年4～6月出発分）の予約を7月1日から受け付けると発表した。今回から英語による申し込みにも対応し、海外への販売を本格的に展開する。
東京地下鉄（東京メトロ）と東京都交通局は6月19日、メトロ南北線・都営三田線白金高輪駅の運賃表に誤りがあり、運賃を取りすぎていた可能性があったと発表した。
小田急電鉄は6月20日、小田急線全70駅で提供している公衆無線LANサービスを拡充し、26日からNTTドコモ「docomo Wi-Fi」の提供を開始すると発表した。改札内コンコースやホームで利用できる。
仙台市交通局は6月20日、地下鉄南北線で運用している1000系の運行を終了すると発表した。1000N系への改造が本年度中に完了するためで、改造前の1000系としては6月28日の運行が最後になる。
東京地下鉄（東京メトロ）は6月19日、グループ長期環境戦略「みんなでECO.」を策定したと発表した。2020年度の鉄道事業におけるエネルギー使用量を、2009年度の実績より増やさないことを目指す。
太田国土交通大臣は、ミャンマー連邦共和国政府のゼーヤー・アウン鉄道運輸大臣との間で、陸上輸送分野での協力覚書を調印したと発表した。
大井川鐵道（株）はSL列車を2013年7月1日～7月7日の期間で七夕列車として運転する。
秋田新幹線「こまち」で使用されているE3系0番台の量産先行車編成（R1編成）が、7月20日の「こまち36号」（秋田発12時57分）の運転を最後に引退することになった。JR東日本秋田支社は、最後の運転に合わせて引退セレモニーを実施する。
