北陸新幹線長野～金沢間の延伸開業（2015年3月14日）にあわせて並行在来線の経営を引き継ぐ第三セクター4社は10月27日、国土交通大臣に旅客運賃の上限認可を申請した。
各社が発表した申請の概要によると、えちごトキめき鉄道は現行JR運賃とほぼ同額。それ以外の3社は値上げする。各社は認可後、実際に適用する運賃（実施運賃）や乗継割引の設定などを届け出る予定だ。
■しなの鉄道（北しなの線）
長野県のしなの鉄道は1997年、北陸新幹線高崎～長野間（長野新幹線）開業時に信越本線軽井沢～篠ノ井間（現在のしなの鉄道線）の経営を引き継いでおり、来年3月の北陸新幹線延伸開業時には信越本線長野～妙高高原間37.3kmも引き継ぐ。同区間の線名は「北しなの線」に変更される。
今回の上限運賃申請では「しなの鉄道線と同水準」にするとしており、現行JR運賃と比較して普通運賃の上限が約1.23倍、通勤定期運賃の上限が約1.49倍、通学定期運賃の上限が約1.47倍になる。実施運賃は上限運賃と同額にする。
普通運賃（大人）は初乗り（1～3km）が現行JR運賃より50円高い190円、長野～豊野間が10円高い250円、長野～妙高高原間が160円高い830円になる。しなの鉄道線各駅から北しなの線各駅までの区間は途中にJRの信越本線篠ノ井～長野間を挟むため、しなの鉄道線と北しなの線の通算距離によって運賃額を算出し、これにJR線の運賃額を足す。妙高高原～上田間の普通運賃は、現行より160円高い1570円になる。
■えちごトキめき鉄道
新潟県内の信越本線妙高高原～直江津間37.7kmと北陸本線市振～直江津間59.3kmは、えちごトキめき鉄道が経営を引き継ぐ。線名は妙高高原～直江津間が「妙高はねうまライン」、直江津～市振間が「日本海ひすいライン」になる。
トキめき鉄道は当初、現行JR運賃の1.3倍に引き上げる計画を立てていたが、後に開業から5年間、現行JR運賃と同額に据え置く方針に転換した。今回申請した上限運賃もJR幹線運賃とほぼ同額となっており、普通運賃の上限は初乗り（1～3km）が140円、妙高高原～直江津間が670円、直江津～市振間が970円、妙高高原～市振間が1660円。ただし子供運賃と通学定期運賃は端数処理がJRと異なるため、10円程度の違いが生じる区間がある。
■あいの風とやま鉄道
富山県内の北陸本線市振～富山～倶利伽羅間100.1kmは、あいの風とやま鉄道が引き継ぐ。普通運賃の上限は、1～3km区間が190円、4～6km区間が250円。その他の主な区間の上限額は、倶利伽羅～石動間が270円、石動～高岡・高岡～富山・富山～滑川各間が420円、滑川～魚津・魚津～黒部各間が270円、黒部～市振間が660円、倶利伽羅～富山間が1020円、富山～市振間が1320円、倶利伽羅～市振間が2300円になる。
とやま鉄道は、上限運賃より安い実施運賃を認可後に届け出て、現行JR運賃との差を縮める方針。これにより普通運賃は1～3km区間が現行JR運賃より20円高い160円、4～6km区間も20円高い210円になる。その他の主な区間の実施運賃（現行JR運賃との差額）は、倶利伽羅～石動間が230円（30円）、石動～高岡・高岡～富山・富山～滑川各間が360円（40円）、滑川～魚津・魚津～黒部各間が230円（30円）、黒部～市振間が560円（60円）、倶利伽羅～富山間が860円（100円）、富山～市振間が1110円（140円）、倶利伽羅～市振間が2060円（120円）になる予定だ。
■IRいしかわ鉄道
石川県内の北陸本線金沢～倶利伽羅間17.8kmを引き継ぐIRいしかわ鉄道は、普通運賃と通勤定期運賃の上限を現行JR運賃の1.19倍、通学定期運賃の上限を1.05倍にする。主な区間の普通運賃の上限は、金沢～東金沢間が170円、金沢～津幡間が290円、津幡～倶利伽羅間が240円、金沢～倶利伽羅間が380円になる。
とやま鉄道と同様、認可後に実施運賃を届け出て値上げ幅を縮小する方針。実施運賃ベースでは普通運賃と通勤定期運賃が現行JR運賃の1.14倍で、通学定期は現行JR運賃と同額にする。これにより主な区間の普通運賃は、金沢～東金沢間が現行JR運賃より20円高い160円、金沢～津幡間が30円高い270円、津幡～倶利伽羅間が30円高い230円、金沢～倶利伽羅間が40円高い360円になる予定だ。
■乗継割引の適用で安くなる区間も
これまでJR東日本・JR西日本の2社が共通のJR幹線運賃を適用してきた長野～金沢間の在来線は第三セクター4社に分割され、4社がそれぞれ定めた運賃が適用される。2社以上をまたぐ区間の運賃額は、原則として各社ごとに定められた運賃額の合算になる。
この原則をそのまま適用すると、とくに短距離の区間では大幅な値上げとなる。このため、並行在来線4社と並行在来線に接続している鉄道路線を運営する関係各社は、短距離区間を中心に乗継割引を設定し、値上げ幅を縮小する方針だ。
新潟県内の高田～（えちごトキめき鉄道に移管）～直江津～（JR東日本が引き続き運営）～犀潟間の場合、現行JR運賃は240円だが、トキめき運賃とJR運賃をそのまま合算すると、160円高い400円になる。現在検討されている案によると、乗継割引の適用により全体で340円とし、値上げ幅を100円に抑える。
一方、北陸本線西金沢～（JR西日本が引き続き運営）～金沢～（IRいしかわ鉄道に移管）東金沢間は現在200円。合算運賃は150円高い350円になるが、乗継割引適用後の運賃は190円とし、現在より10円安くなる予定だ。
