災害による鉄道路線の運休区間は、9月末時点で665.1kmだった。8月の台風連続襲来による不通区間は9月中に大半が再開。8月末時点に比べ800km近い減少となった。
石北本線は10月1日に全線が再開した。根室本線の富良野~東鹿越間も10月17日に再開の予定。石勝線・根室本線のトマム~新得~芽室間は年内の再開を目指しており、札幌~帯広・釧路間の特急も年内の運転再開となる見込みだ。
一方、根室本線の東鹿越~新得間は被害が大きく、復旧工事の着手は2017年春以降になる見込み。再開までには相当な時間がかかるとみられる。
それ以外の路線では、大井川鐵道の井川線が11月頃に全線再開の見込み。12月10日には常磐線相馬~浜吉田間の運転が再開される予定だ。